UA
   BIOPOLÍMERS    Any acadèmic       Versió PDF.
Codi9853Descripció
Crdts. Teor.4MOTIUS ESTRUCTURALS EN PROTEÏNES. PLEGAMENT I DINÀMICA MOLECULAR. DETERMINACIÓ DE L'ESTRUCTURA DE PROTEÏNES. PREDICCIÓ D'ESTRUCTURES. DISSENY I ENGINYERIA DE PROTEÏNES. UTILITZACIÓ D'EINES BIOINFORMÀTIQUES. ÀCIDS NUCLEICS: ESTRUCTURA I DETERMINACIÓ.
Crdts. Pract.2
A efectes d'intercanvis en programes de mobilitat, la càrrega d'aquesta assignatura equival a 7,5 ECTS.


Departamentos y Áreas
DepartamentsÀreaCrdts. Teor.Crdts. Pract.Dpto. Respon.Respon. Acta
AGROQUIMICA I BIOQUIMICABIOQUÍMICA I BIOLOGIA MOLECULAR42


Estudis en què s'imparteix
Llicenciatura en Biologia - pla 2001


Prerequisitos
Sense incompatibles


Incompatibilitats de matricula per continguts equivalents
Sense Dades


Matriculats (2014-15)
Grup (*)Nombre
1 1
TOTAL 1
(*) 1: GRUPO 1 - CAS


Oferida com a lliure elecció (2014-15)
Sense departament
Consulta Gràfica d'Horari
A efectes d'intercanvis en programes de mobilitat, la càrrega d'aquesta assignatura equival aFeu clic ací


Horari (2014-15)
Sense horari


Grups de matricula (2014-15)
Grup (*)QuadrimestreTornIdiomaDistribució (lletra nif)
1 2do. M CAS des de A fins a Z
(*) 1: GRUPO 1 - CAS


Objectius de l'assignatura / competències (2014-15)
Esta asignatura tiene por objetivo el estudio de los aspectos estructurales de los biopolímeros, básicamente proteínas, ácidos nucleicos y carbohidratos. Se incluyen los conceptos necesarios para la descripción de las estructuras y métodos para obtenerlas.


Continguts teòrics i pràctics (2014-15)
Tema 1.Niveles de estructuras en los biopolímeros biológicos.
Tema 2. Motivos de estructura proteica. Dominios estructurales. Clasificación de los dominios. Dominios de tipo I: alfa-hélices antiparalelas. Dominios tipo II: alfa-hélices y láminas beta paralelas. Barriles beta y sillas de montar. Dominios tipo III: Estructuras beta antiparalelas. Alfa/beta estructuras. Estructura terciaria proteínas globulares.
Tema 3. Estructura cuaternaria: agregados de proteínas globulares. Estudio de proteínas transportadoras: mioglobina y hemoglobina. Análisis comparativo de secuencias. Diferencias funcionales entre ambas proteínas como consecuencia de la organización de la estructura cuaternaria de la hemoglobina. Importancia de las sustituciones puntuales en la secuencia de la hemoglobina: anemia falciforme.
Tema 4. Proteínas que unen nucleótidos.
Tema 5. Proteínas de membrana. Escalas de hidrofobicidad. Representación gráfica del índice de hidrofobicidad. Predicción de los segmentos transmembrana en la estructura primaria. Momento hidrofóbico. Modelos de proteínas de membrana.
Tema 6. Plegamiento de proteínas. Mecanismo general del plegamiento de proteínas. Fuerzas que condicionan el plegamiento. Términos entálpicos y entrópicos. El papel del agua en el plegamiento de las proteínas. Los puentes disulfuro. Cinética del plegamiento. Plegamiento proteico en la célula: catalizadores del plegamiento y chaperones moleculares.
Tema 7. Predicción, Ingeniería y Diseño de Estructuras proteicas. Predicción de la estructura a partir de la secuencia. Distintas aproximaciones. Predicción de la estructura secundaria y terciaria. Estabilización de proteínas mediante ingeniería. Papel de los puentes disulfuro. Diseño de estructuras.
Tema 8. Determinación de estructuras proteicas. Técnicas usadas para estudiar las moléculas de proteína. Cristalización. Cristalografía de rayos X. Construcción de un modelo. Métodos de RMN,

PROGRAMA DE PRÁCTICAS.
Prácticas de bioinformática.


Enllaç al programa
Professor/a responsable
Bonete Pérez , Maria Jose


Metodologia docent (2014-15)
Classes teòriques i pràctiques


Tipus d'activitats: teòriques i pràctiques
Laboratoris
Las prácticas de la asignatura son obligatorias. Se introducirá al alumno en el uso de herramientas bioinformáticas para el análisis estructural de proteínas.


Professorat (2014-15)
Grup Professor
TEORIA DE 98531Bonete Pérez, Maria Jose
Enllaços relacionats
http://www.cell.com/trends/biotechnology
http://www.expasy.ch
http://www.journals.elsevier.com/current-opinion-in-biotechnology
http://www.nature.com/nbt/index.html
http://www.proteinscience.org/


Bibliografia

An introduction to molecular biotechnology : fundamentals, methods and applications
Autors:WINK, Michael (ed.)
Edició:Weinheim : Wiley-Blackwell, 2011.
ISBN:978-3-527-32637-2
Recomanat per: BONETE PEREZ, MARIA JOSE (*1)
[ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ] [ Accés a les edicions anteriors ]

Bases del control del metabolismo
Autors:FELL, David
Edició:Barcelona : Omega, 1999.
ISBN:84-282-1153-1
Recomanat per: PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA
[ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ]

Basic biotechnology
Autors:RATLEDGE, Colin; KRISTIANSEN, Bjorn (eds.)
Edició:Cambridge, U.K. : Cambridge University Press, 2007.
ISBN:978-0-521-54958-5 (rúst.)
Recomanat per: BONETE PEREZ, MARIA JOSE (*1)
[ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ] [ Accés a les edicions anteriors ]

Biochemistry
Autors:GARRETT, Reginald H.; GRISHAM, Charles M.
Edició:Boston : Brooks/Cole, 2013.
ISBN:978-0-495-11464-2 (rúst.)
Recomanat per: BONETE PEREZ, MARIA JOSE (*1)
[ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ] [ Accés a les edicions anteriors ]

Bioquímica aplicada: manual para el diseño experimental y el análisis de datos en bioquímica y biología molecular
Autors:CLAROS, M. Gonzalo [et al.]
Edició:Oviedo : Septem Ediciones, 2001.
ISBN:84-95687-01-1
Recomanat per: BONETE PEREZ, MARIA JOSE
PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA
[ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ]

Estructura de proteínas
Autors:GÓMEZ-MORENO, Carlos; SANCHO SANZ, Javier (coords.)
Edició:Barcelona : Ariel , 2003.
ISBN:84-344-8061-6
Recomanat per: PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA (*1)
[ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ]

Introduction to bioinformatics
Autors:LESK, Arthur M.
Edició:Oxford : Oxford University Press, 2002.
ISBN:0-19-925196-7
Recomanat per: BONETE PEREZ, MARIA JOSE
PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA
[ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ] [ Accés a les edicions anteriors ]

Introduction to protein architecture : the structural biology of proteins
Autors:LESK, Arthur M.
Edició:Oxford : Oxford University Press, 2001.
ISBN:0-19-850474-8 (rúst.)
Recomanat per: BONETE PEREZ, MARIA JOSE
PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA
[ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ]

Introduction to protein structure
Autors:BRANDEN, Carl ; TOOZE, John
Edició:New York : Garland, 1999.
ISBN:0-8153-2305-0
Recomanat per: BONETE PEREZ, MARIA JOSE (*1)
[ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ]

Lehninger, principios de bioquímica, septima edición
Autors:Nelson, David L.
Edició:Barcelona : Omega, 2019.
ISBN:978-84-282-1667-8
Recomanat per: BONETE PEREZ, MARIA JOSE (*1)
[ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ] [ Accés a les edicions anteriors ]

Modern experimental biochemistry
Autors:BOYER, Rodney
Edició:San Francisco : Addison Wesley Longman, 2000.
ISBN:0-8053-3111-5
Recomanat per: PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA
[ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ]

Molecular biotechnology : principles and applications of recombinant DNA
Autors: GLICK, Bernard R. ; PATTEN, Cheryl L.
Edició:Washington : American Society for Microbiology, 2017.
ISBN:978-1-55581-936-1
Recomanat per: BONETE PEREZ, MARIA JOSE (*1)
[ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ] [ Accés a les edicions anteriors ]

Molecular cloning : a laboratory manual
Autors:SAMBROOK, Joseph ; RUSSELL, David W.
Edició:New York : Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001.
ISBN:978-0-8969577-4 (o.c.)
Recomanat per: BONETE PEREZ, MARIA JOSE
PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA
[ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ]

Regulación del metabolismo : una perspectiva humana
Autors:FRAYN, Keith N.
Edició:Barcelona : Omega, 1998.
ISBN:84-282-1147-7
Recomanat per: PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA
[ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ]
(*1) Aquest professor ha recomanat el recurs bibliogràfic a tot l'alumnat de l'assignatura.
Dates d'exàmens oficials (2014-15)
ConvocatòriaGrup (*)DataHora d’iniciHora d’fiAules assignadesObservacions:
Període ordinari per a assignatures de segon semestre i anuals -1 01/06/2015 09:00 12:00 A1/1-43S -
Període extraordinari de setembre -1 03/09/2015 09:00 12:00 A1/2-64S -
(*) 1: GRUPO 1 - CAS


Instruments i criteris d'avaluació (2014-15)
Examen final
Se realizará un examen de tipo test del contenido teórico y práctico.