Codi	9853	Descripció
Crdts. Teor.	4	MOTIUS ESTRUCTURALS EN PROTEÏNES. PLEGAMENT I DINÀMICA MOLECULAR. DETERMINACIÓ DE L'ESTRUCTURA DE PROTEÏNES. PREDICCIÓ D'ESTRUCTURES. DISSENY I ENGINYERIA DE PROTEÏNES. UTILITZACIÓ D'EINES BIOINFORMÀTIQUES. ÀCIDS NUCLEICS: ESTRUCTURA I DETERMINACIÓ.
Crdts. Pract.	2
A efectes d'intercanvis en programes de mobilitat, la càrrega d'aquesta assignatura equival a 7,5 ECTS.

Departamentos y Áreas
Departaments	Àrea	Crdts. Teor.	Crdts. Pract.	Dpto. Respon.	Respon. Acta
AGROQUIMICA I BIOQUIMICA	BIOQUÍMICA I BIOLOGIA MOLECULAR	4	2

Estudis en què s'imparteix

Llicenciatura en Biologia - pla 2001

Prerequisitos

Sense incompatibles

Incompatibilitats de matricula per continguts equivalents
Sense Dades

Matriculats (2009-10)
Grup (*)	Nombre
1	5
TOTAL	5

(*) 1: GRUPO 1 - CAS

Oferida com a lliure elecció (2009-10)
Nombre màxim d'alumnes:	Sense màxim
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Consulta Gràfica d'Horari

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Horari (2009-10)
Mode	Grup (*)	Data d’inici	Data de finalització	Dia	Hora d’inici	Hora d’fi	Aula
CLASSE TEÒRICA	1	01/02/2010	31/03/2010	L	08:00	09:00	0012P1001
	1	01/02/2010	31/03/2010	J	10:00	11:00	0012P1001
	1	01/02/2010	31/03/2010	V	10:00	11:00	0007P1060
	1	19/04/2010	20/05/2010	L	10:00	11:00	0007P1063
	1	19/04/2010	20/05/2010	J	10:00	11:00	0007P1063
	1	19/04/2010	20/05/2010	V	10:00	11:00	0007P1063
	1	21/05/2010	21/05/2010	V	09:00	11:00	0007P1060
PRÀCTIQUES DE LABORATORI	1	15/02/2010	08/03/2010	L	11:30	13:30	A1/1-62I
	1	15/03/2010	19/04/2010	L	11:30	13:30	CI/INF6
	1	26/04/2010	03/05/2010	L	11:30	13:30	CI/INF7

(*) CLASE TEÓRICA
	1: GRUPO 1 - CAS
(*) PRÁCTICAS DE LABORATORIO
	1: GRUPO 1 - CAS
	2: GRUPO 2 - CAS

Grups de matricula (2009-10)
Grup (*)	Quadrimestre	Torn	Idioma	Distribució (lletra nif)
1	2do.	M	CAS	des de A fins a Z

(*) 1: GRUPO 1 - CAS

Objectius de l'assignatura / competències (2009-10)

/* Style Definitions */ table.MsoNormalTable {mso-style-name:"Tabla normal"; mso-style-parent:""; font-size:11.0pt;"Calibri","sans-serif"; mso-fareast-"Times New Roman"; mso-bidi-"Times New Roman";} Esta asignatura tiene por objetivo el estudio de los aspectos estructurales de los biopolímeros, básicamente proteínas, ácidos nucleicos y carbohidratos. Se incluyen los conceptos necesarios para la descripción de las estructuras y métodos para obtenerlas.

Continguts teòrics i pràctics (2009-10)

PROGRAMA DE TEORÍA Tema 1.Niveles de estructuras en los biopolímeros biológicos. Tema 2. Motivos de estructura proteica. Dominios estructurales. Clasificación de los dominios. Dominios de tipo I: alfa-hélices antiparalelas. Dominios tipo II: alfa-hélices y láminas beta paralelas. Barriles beta y sillas de montar. Dominios tipo III: Estructuras beta antiparalelas. Alfa/beta estructuras. Estructura terciaria proteínas globulares. Tema 3. Estructura cuaternaria: agregados de proteínas globulares. Estudio de proteínas transportadoras: mioglobina y hemoglobina. Análisis comparativo de secuencias. Diferencias funcionales entre ambas proteínas como consecuencia de la organización de la estructura cuaternaria de la hemoglobina. Importancia de las sustituciones puntuales en la secuencia de la hemoglobina: anemia falciforme. Tema 4. Proteínas que unen nucleótidos. Tema 5. Proteínas de membrana. Escalas de hidrofobicidad. Representación gráfica del índice de hidrofobicidad. Predicción de los segmentos transmembrana en la estructura primaria. Momento hidrofóbico. Modelos de proteínas de membrana. Tema 6. Plegamiento de proteínas. Mecanismo general del plegamiento de proteínas. Fuerzas que condicionan el plegamiento. Términos entálpicos y entrópicos. El papel del agua en el plegamiento de las proteínas. Los puentes disulfuro. Cinética del plegamiento. Plegamiento proteico en la célula: catalizadores del plegamiento y chaperones moleculares. Tema 7. Predicción, Ingeniería y Diseño de Estructuras proteicas. Predicción de la estructura a partir de la secuencia. Distintas aproximaciones. Predicción de la estructura secundaria y terciaria. Estabilización de proteínas mediante ingeniería. Papel de los puentes disulfuro. Diseño de estructuras. Tema 8. Determinación de estructuras proteicas. Técnicas usadas para estudiar las moléculas de proteína. Cristalización. Cristalografía de rayos X. Construcción de un modelo. Métodos de RMN, Tema 9. Estructura primaria del DNA. Estructura secundaria del DNA. Parámetros estructurales del DNA. Interacciones que estabilizan la estructura secundaria de ácidos nucleicos: puentes de hidrógeno, apilamiento de bases, interacciones iónicas. Familias de DNA: DNA B, DNA A, DNA Z. Técnicas de estudio de la estructura secundaria del DNA. Tema 10.Estructura terciaria del DNA. DNA rígido y DNA flexible. Curvamiento de DNA. Bucles de DNA. Superenrollamiento de DNA y formas topológicas. Topoisomerasas. Tema 11. Estructura secundaria y terciaria de RNAs. Estructura secundaria del RNA. Predicción y determinación de la estructura secundaria de RNAs. Estructuras terciarias del RNA. Determinación de estructuras terciarias de RNAs. tRNAs. PROGRAMA DE PRÁCTICAS. Prácticas de bioinformática. Se realizarán en las salas de ordenadores.

Enllaç al programa

Professor/a responsable

Bonete Pérez , Maria Jose

Metodologia docent (2009-10)

Classes teòriques i pràctiques

Tipus d'activitats: teòriques i pràctiques

Laboratoris

Las prácticas son obligatorias.

Professorat (2009-10)
	Grup	Professor
TEORIA DE 9853	1	Bonete Pérez, Maria Jose
PRÁCTICAS DE LABORATORIO DE 9853	1	Esclapez Espliego, Julia Maria
	2	Pire Galiana, Carmen Lucia

Enllaços relacionats

http://www.cell.com/trends/biotechnology

http://www.expasy.ch

http://www.journals.elsevier.com/current-opinion-in-biotechnology

http://www.nature.com/nbt/index.html

http://www.proteinscience.org/

Bibliografia

Ordena pel títol del llibre Ordena pel professor que recomana

Bases del control del metabolismo Autors: FELL, David Edició: Barcelona : Omega, 1999. ISBN: 84-282-1153-1 Recomanat per: PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA [ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ] Bioquímica aplicada: manual para el diseño experimental y el análisis de datos en bioquímica y biología molecular Autors: CLAROS, M. Gonzalo [et al.] Edició: Oviedo : Septem Ediciones, 2001. ISBN: 84-95687-01-1 Recomanat per: BONETE PEREZ, MARIA JOSE PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA [ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ] Estructura de proteínas Autors: GÓMEZ-MORENO, Carlos; SANCHO SANZ, Javier (coords.) Edició: Barcelona : Ariel , 2003. ISBN: 84-344-8061-6 Recomanat per: PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA (*1) [ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ] Introduction to bioinformatics Autors: LESK, Arthur M. Edició: Oxford : Oxford University Press, 2002. ISBN: 0-19-925196-7 Recomanat per: BONETE PEREZ, MARIA JOSE PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA [ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ] [ Accés a les edicions anteriors ] Introduction to protein architecture : the structural biology of proteins Autors: LESK, Arthur M. Edició: Oxford : Oxford University Press, 2001. ISBN: 0-19-850474-8 (rúst.) Recomanat per: BONETE PEREZ, MARIA JOSE PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA [ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ] Lehninger, principios de bioquímica, septima edición Autors: Nelson, David L. Edició: Barcelona : Omega, 2019. ISBN: 978-84-282-1667-8 Recomanat per: BONETE PEREZ, MARIA JOSE (*1) [ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ] [ Accés a les edicions anteriors ] Modern experimental biochemistry Autors: BOYER, Rodney Edició: San Francisco : Addison Wesley Longman, 2000. ISBN: 0-8053-3111-5 Recomanat per: PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA [ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ] Molecular cloning : a laboratory manual Autors: SAMBROOK, Joseph ; RUSSELL, David W. Edició: New York : Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001. ISBN: 978-0-8969577-4 (o.c.) Recomanat per: BONETE PEREZ, MARIA JOSE PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA [ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ] Regulación del metabolismo : una perspectiva humana Autors: FRAYN, Keith N. Edició: Barcelona : Omega, 1998. ISBN: 84-282-1147-7 Recomanat per: PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA [ Accés al catàleg de la biblioteca universitària ]

(*1) Aquest professor ha recomanat el recurs bibliogràfic a tot l'alumnat de l'assignatura.

Dates d'exàmens oficials (2009-10)
Convocatòria	Grup (*)	Data	Hora d’inici	Hora d’fi	Aules assignades	Observacions:
Període ordinari per a assignatures de segon semestre i anuals	-1	28/05/2010	18:00	21:00	A1/0-14S	-
Període extraordinari de setembre	-1	01/09/2010	18:00	21:00	A1/1-42S	-

(*) 1: GRUPO 1 - CAS

Instruments i criteris d'avaluació (2009-10)

Examen final

/* Style Definitions */ table.MsoNormalTable {mso-style-name:"Tabla normal"; mso-style-parent:""; font-size:11.0pt;"Calibri","sans-serif"; mso-fareast-"Times New Roman"; mso-bidi-"Times New Roman";} - Se realizara un examen de tipo test del contenido teórico. La parte práctica de la asignatura se evaluará con la entrega de un trabajo final de las prácticas realizadas.. La nota final será 70% de la nota teórica más 30% de la nota práctica. - Además se evaluará la presentación de temas por parte del alumno, pudiendo obtener 1 punto a sumar a la nota final.