Código	9853	Descripción
Crdts. Teor.	4	MOTIVOS ESTRUCTURALES EN PROTEÍNAS. PLEGAMIENTO Y DINÁMICA MOLECULAR. DETERMINACIÓN ESTRUCTURA DE PROTEÍNAS. PREDICCIÓN DE ESTRUCTURAS. DISEÑO E INGENIERÍA DE PROTEÍNAS. UTILIZACIÓN DE HERRAMIENTAS BIOINFORMÁTICAS. ÁCIDOS NUCLEICOS: ESTRUCTURA Y DETERMINACIÓN.
Crdts. Pract.	2
A efectos de intercambios en programas de movilidad, la carga de esta asignatura equivale a 7,5 ECTS.

Departamentos y Áreas
Departamentos	Área	Crdts. Teor.	Crdts. Pract.	Dpto. Respon.	Respon. Acta
AGROQUIMICA Y BIOQUIMICA	BIOQUIMICA Y BIOLOGIA MOLECULAR	4	2

Estudios en los que se imparte

Licenciatura en Biología - plan 2001

Pre-requisitos

Sin incompatibles

Incompatibilidades de matrícula por contenidos equivalentes
Sin Datos

Matriculados (2009-10)
Grupo (*)	Número
1	5
TOTAL	5

(*) 1: GRUPO 1 - CAS

Ofertada como libre elección (2009-10)
Número máximo de alumnos:	Sin límite
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Consulta Gráfica de Horario

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Horario (2009-10)
Modo	Grupo (*)	Día inicio	Día fin	Día	Hora inicio	Hora fin	Aula
CLASE TEÓRICA	1	01/02/2010	31/03/2010	L	08:00	09:00	0012P1001
	1	01/02/2010	31/03/2010	J	10:00	11:00	0012P1001
	1	01/02/2010	31/03/2010	V	10:00	11:00	0007P1060
	1	19/04/2010	20/05/2010	L	10:00	11:00	0007P1063
	1	19/04/2010	20/05/2010	J	10:00	11:00	0007P1063
	1	19/04/2010	20/05/2010	V	10:00	11:00	0007P1063
	1	21/05/2010	21/05/2010	V	09:00	11:00	0007P1060
PRÁCTICAS DE LABORATORIO	1	15/02/2010	08/03/2010	L	11:30	13:30	A1/1-62I
	1	15/03/2010	19/04/2010	L	11:30	13:30	CI/INF6
	1	26/04/2010	03/05/2010	L	11:30	13:30	CI/INF7

(*) CLASE TEÓRICA
	1: GRUPO 1 - CAS
(*) PRÁCTICAS DE LABORATORIO
	1: GRUPO 1 - CAS
	2: GRUPO 2 - CAS

Grupos de matricula (2009-10)
Grupo (*)	Cuatrimestre	Turno	Idioma	Distribución (letra nif)
1	2do.	M	CAS	desde A hasta Z

(*) 1: GRUPO 1 - CAS

Objetivos de las asignatura / competencias (2009-10)

/* Style Definitions */ table.MsoNormalTable {mso-style-name:"Tabla normal"; mso-style-parent:""; font-size:11.0pt;"Calibri","sans-serif"; mso-fareast-"Times New Roman"; mso-bidi-"Times New Roman";} Esta asignatura tiene por objetivo el estudio de los aspectos estructurales de los biopolímeros, básicamente proteínas, ácidos nucleicos y carbohidratos. Se incluyen los conceptos necesarios para la descripción de las estructuras y métodos para obtenerlas.

Contenidos teóricos y prácticos (2009-10)

PROGRAMA DE TEORÍA Tema 1.Niveles de estructuras en los biopolímeros biológicos. Tema 2. Motivos de estructura proteica. Dominios estructurales. Clasificación de los dominios. Dominios de tipo I: alfa-hélices antiparalelas. Dominios tipo II: alfa-hélices y láminas beta paralelas. Barriles beta y sillas de montar. Dominios tipo III: Estructuras beta antiparalelas. Alfa/beta estructuras. Estructura terciaria proteínas globulares. Tema 3. Estructura cuaternaria: agregados de proteínas globulares. Estudio de proteínas transportadoras: mioglobina y hemoglobina. Análisis comparativo de secuencias. Diferencias funcionales entre ambas proteínas como consecuencia de la organización de la estructura cuaternaria de la hemoglobina. Importancia de las sustituciones puntuales en la secuencia de la hemoglobina: anemia falciforme. Tema 4. Proteínas que unen nucleótidos. Tema 5. Proteínas de membrana. Escalas de hidrofobicidad. Representación gráfica del índice de hidrofobicidad. Predicción de los segmentos transmembrana en la estructura primaria. Momento hidrofóbico. Modelos de proteínas de membrana. Tema 6. Plegamiento de proteínas. Mecanismo general del plegamiento de proteínas. Fuerzas que condicionan el plegamiento. Términos entálpicos y entrópicos. El papel del agua en el plegamiento de las proteínas. Los puentes disulfuro. Cinética del plegamiento. Plegamiento proteico en la célula: catalizadores del plegamiento y chaperones moleculares. Tema 7. Predicción, Ingeniería y Diseño de Estructuras proteicas. Predicción de la estructura a partir de la secuencia. Distintas aproximaciones. Predicción de la estructura secundaria y terciaria. Estabilización de proteínas mediante ingeniería. Papel de los puentes disulfuro. Diseño de estructuras. Tema 8. Determinación de estructuras proteicas. Técnicas usadas para estudiar las moléculas de proteína. Cristalización. Cristalografía de rayos X. Construcción de un modelo. Métodos de RMN, Tema 9. Estructura primaria del DNA. Estructura secundaria del DNA. Parámetros estructurales del DNA. Interacciones que estabilizan la estructura secundaria de ácidos nucleicos: puentes de hidrógeno, apilamiento de bases, interacciones iónicas. Familias de DNA: DNA B, DNA A, DNA Z. Técnicas de estudio de la estructura secundaria del DNA. Tema 10.Estructura terciaria del DNA. DNA rígido y DNA flexible. Curvamiento de DNA. Bucles de DNA. Superenrollamiento de DNA y formas topológicas. Topoisomerasas. Tema 11. Estructura secundaria y terciaria de RNAs. Estructura secundaria del RNA. Predicción y determinación de la estructura secundaria de RNAs. Estructuras terciarias del RNA. Determinación de estructuras terciarias de RNAs. tRNAs. PROGRAMA DE PRÁCTICAS. Prácticas de bioinformática. Se realizarán en las salas de ordenadores.

Más información

Profesor/a responsable

Bonete Pérez , Maria Jose

Metodología docente (2009-10)

Clases teóricas y prácticas

Tipo de actividades: teóricas y prácticas

Laboratorios

Las prácticas son obligatorias.

Profesores (2009-10)
	Grupo	Profesor/a
TEORIA DE 9853	1	Bonete Pérez, Maria Jose
PRÁCTICAS DE LABORATORIO DE 9853	1	Esclapez Espliego, Julia Maria
	2	Pire Galiana, Carmen Lucia

Enlaces relacionados

http://www.cell.com/trends/biotechnology

http://www.expasy.ch

http://www.journals.elsevier.com/current-opinion-in-biotechnology

http://www.nature.com/nbt/index.html

http://www.proteinscience.org/

Bibliografía

Ordenar por título del libro Ordenar por profesor que lo recomienda

Bases del control del metabolismo Autor(es): FELL, David Edición: Barcelona : Omega, 1999. ISBN: 84-282-1153-1 Recomendado por: PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA [ Acceso al catálogo de la biblioteca universitaria ] Bioquímica aplicada: manual para el diseño experimental y el análisis de datos en bioquímica y biología molecular Autor(es): CLAROS, M. Gonzalo [et al.] Edición: Oviedo : Septem Ediciones, 2001. ISBN: 84-95687-01-1 Recomendado por: BONETE PEREZ, MARIA JOSE PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA [ Acceso al catálogo de la biblioteca universitaria ] Estructura de proteínas Autor(es): GÓMEZ-MORENO, Carlos; SANCHO SANZ, Javier (coords.) Edición: Barcelona : Ariel , 2003. ISBN: 84-344-8061-6 Recomendado por: PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA (*1) [ Acceso al catálogo de la biblioteca universitaria ] Introduction to bioinformatics Autor(es): LESK, Arthur M. Edición: Oxford : Oxford University Press, 2002. ISBN: 0-19-925196-7 Recomendado por: BONETE PEREZ, MARIA JOSE PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA [ Acceso al catálogo de la biblioteca universitaria ] [ Acceso a las ediciones anteriores ] Introduction to protein architecture : the structural biology of proteins Autor(es): LESK, Arthur M. Edición: Oxford : Oxford University Press, 2001. ISBN: 0-19-850474-8 (rúst.) Recomendado por: BONETE PEREZ, MARIA JOSE PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA [ Acceso al catálogo de la biblioteca universitaria ] Lehninger, principios de bioquímica, septima edición Autor(es): Nelson, David L. Edición: Barcelona : Omega, 2019. ISBN: 978-84-282-1667-8 Recomendado por: BONETE PEREZ, MARIA JOSE (*1) [ Acceso al catálogo de la biblioteca universitaria ] [ Acceso a las ediciones anteriores ] Modern experimental biochemistry Autor(es): BOYER, Rodney Edición: San Francisco : Addison Wesley Longman, 2000. ISBN: 0-8053-3111-5 Recomendado por: PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA [ Acceso al catálogo de la biblioteca universitaria ] Molecular cloning : a laboratory manual Autor(es): SAMBROOK, Joseph ; RUSSELL, David W. Edición: New York : Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001. ISBN: 978-0-8969577-4 (o.c.) Recomendado por: BONETE PEREZ, MARIA JOSE PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA [ Acceso al catálogo de la biblioteca universitaria ] Regulación del metabolismo : una perspectiva humana Autor(es): FRAYN, Keith N. Edición: Barcelona : Omega, 1998. ISBN: 84-282-1147-7 Recomendado por: PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA [ Acceso al catálogo de la biblioteca universitaria ]

(*1) Este profesor ha recomendado el recurso bibliográfico a todos los alumnos de la asignatura.

Fechas de exámenes oficiales (2009-10)
Convocatoria	Grupo (*)	fecha	Hora inicio	Hora fin	Aula(s) asignada(s)	Observ:
Periodo ordinario para asignaturas de segundo semestre y anuales	-1	28/05/2010	18:00	21:00	A1/0-14S	-
Periodo extraordinario de septiembre	-1	01/09/2010	18:00	21:00	A1/1-42S	-

(*) 1: GRUPO 1 - CAS

Instrumentos y criterios de evaluación (2009-10)

Examen final

/* Style Definitions */ table.MsoNormalTable {mso-style-name:"Tabla normal"; mso-style-parent:""; font-size:11.0pt;"Calibri","sans-serif"; mso-fareast-"Times New Roman"; mso-bidi-"Times New Roman";} - Se realizara un examen de tipo test del contenido teórico. La parte práctica de la asignatura se evaluará con la entrega de un trabajo final de las prácticas realizadas.. La nota final será 70% de la nota teórica más 30% de la nota práctica. - Además se evaluará la presentación de temas por parte del alumno, pudiendo obtener 1 punto a sumar a la nota final.