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36656 - PROTEÓMICA Y GENÓMICA FUNCIONAL (2017-18)

Datos generales  

Código: 36656
Profesor/a responsable:
BRU MARTINEZ, ROQUE
Crdts. ECTS: 2,00
Créditos teóricos: 0,42
Créditos prácticos: 0,38
Carga no presencial: 1,20

Departamentos con docencia

Estudios en los que se imparte



Competencias y objetivos

Contexto de la asignatura para el curso 2017-18

Asignatura optativa de segundo semestre. Aplicable a investigacion y control analitico basado en proteinas para diferentes areas de conocimiento: biomedicina, clinica, agroalimentacion, medio ambiente,...

 

 

Competencias de la asignatura (verificadas por ANECA en grados y másteres oficiales)

MÁSTER UNIVERSITARIO EN BIOMEDICINA

 

Competencias propias del módulo específico de biotecnología para la salud y la sostenibilidad

  • CEBT15 : Conocer las estrategias globales, herramientas y metodologías para el análisis proteómico.
  • CEBT16 : Saber analizar de forma cuantitativa muestras de proteínas mediante de electroforesis bidimensional y saber analizar grandes volúmenes de datos de espectrometría de masas para identificar y cuantificar proteínas purificadas o mezclas complejas.
  • CEBT17 : Conocer las estrategias para establecer la función biológica de genes y proteínas.
  • CEBT5 : Utilización de protocolos y equipos de análisis estructural y funcional de genes y proteínas.

 

MÁSTER UNIVERSITARIO EN BIOTECNOLOGÍA PARA LA SALUD Y LA SOSTENIBILIDAD

 

Competencias específicas:>>Módulo Específico de Biotecnología para la Salud y la Sostenibilidad

  • CEBT15 : Conocer las estrategias globales, herramientas y metodologías para el análisis proteómico.
  • CEBT16 : Conocer las estrategias globales, herramientas y metodologías para el análisis proteómico.
  • CEBT17 : Conocer las estrategias para establecer la función biológica de genes y proteínas.
  • CEBT5 : Utilización de protocolos y equipos de análisis estructural y funcional de genes y proteínas.

 

MÁSTER UNIVERSITARIO EN QUÍMICA MÉDICA

 

Competencias del módulo optativo de libre elección de Biotecnología

  • CEBT15 : Conocer las estrategias globales, herramientas y metodologías para el análisis proteómico.
  • CEBT16 : Interpretar información de electroforesis bidimensional y espectrometría de masas para identificar y cuantificar proteínas en mezclas complejas.
  • CEBT17 : Conocer las estrategias para establecer la función biológica de genes y proteínas.
  • CEBT5 : Utilización de protocolos y equipos de análisis estructural y funcional de genes y proteínas.

 

Competencia exclusiva de la asignatura

Sin datos

Resultados de aprendizaje (Objetivos formativos)

  • Conocer el objeto, la metodología y campo de aplicación de la proteómica.
  • Saber diseñar un experimento proteómico.
  • Adquirir un conocimiento avanzado de las técnicas electroforéticas y cromatográficas empleadas en proteómica.
  • Adquirir un conocimiento avanzado de las técnicas de espectrometría de masas y de interpretación de espectros MS y MS/MS empleadas en proteómica.
  • Conocer las diferentes estrategias de proteómica cuantitativa.
  • Saber identificar proteínas en base a información de espectrometría de masas.
  • Conocer las estrategias para asignar la función biológica de genes y proteínas
  • Conocer los tipos de evidencias utilizados para asignar función a genes y proteínas.
  • Saber utilizar herramientas bioinformáticas para asignar la función a secuencias de nucleótidos y aminoácidos.

Objetivos específicos indicados por el profesorado para el curso 2017-18

Ver generales


Contenidos y bibliografía

Contenidos para el curso 2017-18

El proteoma. Relación genoma-proteoma. Electroforesis 2D. Cromatografia líquida multidimensional. Espectrometría de masas en proteómica. Bases de datos usadas en proteómica. Motores de búsqueda. Identificación de proteínas y detección de modificaciones post-traduccionales basada en espectrometría de masas. Secuenciación “de novo”. Proteómica cuantitativa. Genética reversa en genómica funcional. Análisis de secuencias en genómica funcional. Anotación e interpretación biológica de experimentos proteómicos.

 

 

Enlaces relacionados

Sin datos

 

Bibliografía

Serum/plasma proteomics : methods and protocols
Autor(es): Simpson, Richard J. ; Greening, David W.
Edición: New York : Humana Press, 2017;
ISBN: 978-1-4939-7056-8
Categoría: Complementario

Proteins and proteomics : a laboratory manual
Autor(es): SIMPSON, Richard J.
Edición: Cold Spring Harbor, NY : Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2003;
ISBN: 0-87969-554-4 (rúst.)
Categoría: Sin especificar

Posttranslational modifications of proteins: tools for functional proteomics
Autor(es): KANNICHT, Christoph N. (ed.)
Edición: Totowa, NJ : Humana Press, 2002;
ISBN: 0-89603-678-2 (cartoné)
Categoría: Sin especificar

Functional plant genomics
Autor(es): Briat, Jean-Francois
Edición: Enfield, NH : Science Publishers, 2007;
ISBN: 978-1-57808-506-4
Categoría: Sin especificar

Mass spectrometry of proteins and peptides : methods and protocols
Autor(es): LIPTON, Mary S. ; PASA-TOLIC, Ljiljana (ed.)
Edición: New York : Humana , 2009;
ISBN: 978-1-934115-48-0
Categoría: Sin especificar

Quantitative proteomics by mass spectrometry
Autor(es): SECHI, Salvatore
Edición: Totowa (New Jersey) : Humana Press, 2007;
ISBN: 1-58829-571-0 (cart.)
Categoría: Sin especificar

Mechanisms in transcriptional regulation
Autor(es): COUREY, Albert J.
Edición: Oxford : Blackwell, 2008;
ISBN: 978-1-4051-0370-1
Categoría: Sin especificar

Plant proteomics : methods and protocols, second edition
Autor(es): JORRIN-NOVO, Jesús V. [et al.] (Eds.)
Edición: New York : Humana Press, 2014;
ISBN: 978-1-62703-630-6
Categoría: Sin especificar

Evaluación

Instrumentos y criterios de evaluación 2017-18

Sin datos

Descripción Criterio Tipo Ponderación
Exposiciones orales

En los seminarios cada alumno debera hacer una exposición sobre temas ofrecidos por el profesor.

 ACTIVIDADES DE EVALUACIÓN DURANTE EL SEMESTRE 50
Trabajo práctico

Valoracion de informe del trabajo práctico

 ACTIVIDADES DE EVALUACIÓN DURANTE EL SEMESTRE 50

 

Fechas de pruebas de evaluación oficiales para el curso 2017-18

Sin datos

 

 



Profesorado

BRU MARTINEZ, ROQUE
Profesor/a responsable

  • CLASE TEÓRICA: Grupos:
    • 1
  • TUTORÍAS GRUPALES: Grupos:
    • T1
  • SEMINARIO / TEÓRICO-PRÁCTICO / TALLER: Grupos:
    • S1

SELLES MARCHART, SUSANA

  • PRÁCTICAS CON ORDENADOR: Grupos:
    • O1

 

Grupos

CLASE TEÓRICA

Grupo Semestre Turno Idioma Matriculados
Gr. 1 (CLASE TEÓRICA) : 1 2S Tarde CAS 7


PRÁCTICAS CON ORDENADOR

Grupo Semestre Turno Idioma Matriculados
Gr. O1 (PRÁCTICAS CON ORDENADOR) : O1 2S Tarde CAS 0


TUTORÍAS GRUPALES

Grupo Semestre Turno Idioma Matriculados
Gr. T1 (TUTORÍAS GRUPALES) : T1 2S Tarde CAS 0


SEMINARIO / TEÓRICO-PRÁCTICO / TALLER

Grupo Semestre Turno Idioma Matriculados
Gr. S1 (SEMINARIO / TEÓRICO-PRÁCTICO / TALLER) : S1 2S Tarde CAS 0




Horarios

CLASE TEÓRICA

Grupo Fecha inicio Fecha fin Día Hora inicio Hora fin Aula
1 20/03/2018 20/03/2018 MAR 15:00 16:00 CI/0004  
1 27/03/2018 27/03/2018 MAR 15:00 16:00 CI/0004  
1 28/03/2018 28/03/2018 MIE 15:00 16:00 CI/0004  
1 10/04/2018 10/04/2018 MAR 15:00 16:00 CI/0004  
1 19/04/2018 19/04/2018 JUE 15:00 16:00 CI/0004  
1 19/04/2018 19/04/2018 JUE 16:00 17:00 CI/0004  
1 20/04/2018 20/04/2018 VIE 15:00 16:00 CI/0004  
1 25/04/2018 25/04/2018 MIE 15:00 16:00 CI/0004  
1 31/05/2018 31/05/2018 JUE 15:30 16:00 CI/0004  
1 31/05/2018 31/05/2018 JUE 17:00 18:00 CI/0004  
1 31/05/2018 31/05/2018 JUE 16:00 17:00 CI/0004  

PRÁCTICAS CON ORDENADOR

Grupo Fecha inicio Fecha fin Día Hora inicio Hora fin Aula
O1 26/04/2018 26/04/2018 JUE 15:00 18:00 CI/INF8  

TUTORÍAS GRUPALES

Grupo Fecha inicio Fecha fin Día Hora inicio Hora fin Aula
T1 10/04/2018 10/04/2018 MAR 16:00 17:00 CI/0004  
T1 27/04/2018 27/04/2018 VIE 15:00 16:00 CI/0004  

SEMINARIO / TEÓRICO-PRÁCTICO / TALLER

Grupo Fecha inicio Fecha fin Día Hora inicio Hora fin Aula
S1 07/05/2018 07/05/2018 LUN 16:00 17:00 CI/0004  
S1 07/05/2018 07/05/2018 LUN 15:00 16:00 CI/0004  
S1 08/05/2018 08/05/2018 MAR 15:00 16:00 CI/0004  
S1 08/05/2018 08/05/2018 MAR 16:00 17:00 CI/0004